藏醫(yī)藥學的發(fā)展，至少有2000多年的歷史。據(jù)史料記載，公元前200多年，藏王聶赤贊布提出六個疑點，一位叫孜拉嘎瑪躍德的人回答了其中之一，曰：有毒就有藥，說明了毒可成藥、以毒攻毒的醫(yī)理。此時還出現(xiàn)了名醫(yī)杰普赤西，他研制的“吐迥旺日”藥丸，也是運用了以毒攻毒的理論；到了4世紀的拉妥妥日時期，采用了寒病熱治、熱病寒治的治療醫(yī)理。此時還出現(xiàn)了著名藏醫(yī)師通格妥覺堅，他從父親嘎啟比奇處學習了印度醫(yī)學，豐富了藏醫(yī)理論和實踐。從史料記載看，當時通格妥覺堅這樣的醫(yī)師，已經(jīng)能夠在莫龍袞巴扎的眼睛上開刀動手術(shù)；仲年德烏患了毒龍麻風病后，為了避免傳染家人，獨自居住在地下塘穴之中，說明那個時代的醫(yī)師及其醫(yī)療技術(shù)及預防疾病的手段等已達到了較高的水平。

  到了公元7世紀，藏醫(yī)的醫(yī)藥理論和醫(yī)療實踐相結(jié)合方面取得了較大的發(fā)展。此時藏王松贊干布基本統(tǒng)一了西藏高原，同唐朝聯(lián)姻修好，迎娶文成公主入藏。當時有漢地的摩訶弟瓦和尚及西藏的大譯師達磨郭卡把文成公主攜帶的《醫(yī)法大論》譯成藏文并予以厘定，這是藏文譯成的第一部漢醫(yī)醫(yī)典，可惜此書早已散失，但其精華部分均收輯于西藏的醫(yī)學名著《四部醫(yī)典》之中。松贊干布為了藏醫(yī)的繼承和發(fā)展，挑選了一部分藏家子弟學習醫(yī)典，為藏醫(yī)的發(fā)展做出了巨大的貢獻。

  8世紀初，贊布赤德祖丹迎娶金城公主入藏。公主進藏時攜帶了眾多醫(yī)典。其中漢地大乘和尚與西藏澤師毗盧遮那共同翻譯了《月王藥診》（亦澤《醫(yī)法月王論》），它是現(xiàn)存最早的藏醫(yī)學著作。在法王赤松德贊時期，出現(xiàn)了“四方名醫(yī)”、“遠方九太醫(yī)”等名家，使藏醫(yī)得到空前的發(fā)展。在諸多名醫(yī)之中，玉妥寧瑪·云丹貢布的名聲最響，成就最大。他曾親赴藏區(qū)各地，收集民間醫(yī)藥的驗方，并加以研究，還赴尼泊爾、印度等國，研習醫(yī)理，同時迎請中醫(yī)及尼泊爾、印度醫(yī)生入藏，吸收優(yōu)秀的醫(yī)學文化。在此基礎(chǔ)上，玉妥寧瑪·云丹貢布撰寫了《四部醫(yī)典》這部舉世聞名的藏醫(yī)典籍，標志著藏醫(yī)獨具特色體系的完成。到了13世紀初，玉妥寧瑪之后裔玉妥瑪·云丹貢布在研習藏醫(yī)醫(yī)典的同時，學習中醫(yī)《月王藥診》及印度的醫(yī)學八支理論，對《四部醫(yī)典》進行補充厘定，使其更加完善、規(guī)范。

到了14世紀，出現(xiàn)了南北地區(qū)氣候的不同而采取不同治療方法的強巴派及蘇卡派，推動了藏醫(yī)藥理論的發(fā)展。此時各地醫(yī)生紛紛著書立說，涌現(xiàn)了許多優(yōu)秀的醫(yī)典及《四部醫(yī)典》注疏。

17世紀,五世達賴喇嘛非常重視藏醫(yī)事業(yè)的發(fā)展，曾創(chuàng)建了哲蚌寺索日卓翩林、日喀則索日常松堆白林、布達拉宮拉旺角、桑普尼瑪塘等藏醫(yī)學校。五世達賴喇嘛的第司桑結(jié)嘉措，為藏醫(yī)事業(yè)做出了不可磨滅的貢獻。

1689年他完成《四部醫(yī)典釋論·藍琉璃》一書；1690年編著了《秘廖續(xù)補注》一書；1703年完成了《醫(yī)學概論·仙人喜筵》一書，這些著作成為許多醫(yī)生治療的參考依據(jù)和研習醫(yī)術(shù)的最佳典籍。第司桑結(jié)嘉措還根據(jù)《月王藥診》和自己所著《藍琉璃》、《醫(yī)學概論》以及強巴派醫(yī)學理論、倫頂朗杰多吉所傳《續(xù)義釋論》等內(nèi)容加以補充和整理，首創(chuàng)醫(yī)學唐卡掛圖79幅。第司桑結(jié)嘉措非常重視人才的培養(yǎng)，1696年他創(chuàng)建了藥王山日齊卓翩林醫(yī)學院，培養(yǎng)了一批醫(yī)學人才，他們著書立說，傳播醫(yī)理，飲譽全藏，在當時的歷史條件下，達到了藏醫(yī)發(fā)展的較高水平。

十三世達賴喇嘛時期，藏醫(yī)學也有一定的發(fā)展。此時出現(xiàn)了許多著名的藏學家，諸如噶瑪吉美吉森格、喇嘛吉美赤列、太醫(yī)烏堅丹增嘉措、多吉堅贊、扎康基巧堪布強巴土旺、恰布巴當曲班丹、欽饒羅布大師等。他們編著醫(yī)書，傳授醫(yī)理，推動了藏醫(yī)事業(yè)的繼承和發(fā)展。在這些醫(yī)學家之中，欽饒羅布大師功勛最為顯著。他曾廣拜名師，研習顯密經(jīng)典、天文歷算，熟諳《四部醫(yī)典》為主之醫(yī)典，撰寫了《根本續(xù)植株·醫(yī)學海藏》、《藥草標本集要·奇妙金穗》、《接生法·利眾月寶之鑒》、《后續(xù)總義·打開經(jīng)典之匙》、《后續(xù)切脈查尿補注》、《放血療法總義·童子語飾》等十幾本著作。